LCOV - code coverage report
Current view: top level - frmts/hdf5 - s104dataset.cpp (source / functions) Hit Total Coverage
Test: gdal_filtered.info Lines: 140 179 78.2 %
Date: 2024-11-21 22:18:42 Functions: 8 8 100.0 %

          Line data    Source code
       1             : /******************************************************************************
       2             :  *
       3             :  * Project:  Hierarchical Data Format Release 5 (HDF5)
       4             :  * Purpose:  Read S104 datasets.
       5             :  * Author:   Even Rouault <even dot rouault at spatialys dot com>
       6             :  *
       7             :  ******************************************************************************
       8             :  * Copyright (c) 2023, Even Rouault <even dot rouault at spatialys dot com>
       9             :  *
      10             :  * SPDX-License-Identifier: MIT
      11             :  ****************************************************************************/
      12             : 
      13             : #include "cpl_port.h"
      14             : #include "hdf5dataset.h"
      15             : #include "hdf5drivercore.h"
      16             : #include "gh5_convenience.h"
      17             : #include "rat.h"
      18             : #include "s100.h"
      19             : 
      20             : #include "gdal_priv.h"
      21             : #include "gdal_proxy.h"
      22             : #include "gdal_rat.h"
      23             : 
      24             : #include <limits>
      25             : 
      26             : /************************************************************************/
      27             : /*                             S104Dataset                              */
      28             : /************************************************************************/
      29             : 
      30             : class S104Dataset final : public S100BaseDataset
      31             : {
      32             :   public:
      33           4 :     explicit S104Dataset(const std::string &osFilename)
      34           4 :         : S100BaseDataset(osFilename)
      35             :     {
      36           4 :     }
      37             : 
      38             :     static GDALDataset *Open(GDALOpenInfo *);
      39             : };
      40             : 
      41             : /************************************************************************/
      42             : /*                            S104RasterBand                            */
      43             : /************************************************************************/
      44             : 
      45             : class S104RasterBand final : public GDALProxyRasterBand
      46             : {
      47             :     friend class S104Dataset;
      48             :     std::unique_ptr<GDALDataset> m_poDS{};
      49             :     GDALRasterBand *m_poUnderlyingBand = nullptr;
      50             :     std::string m_osUnitType{};
      51             :     std::unique_ptr<GDALRasterAttributeTable> m_poRAT{};
      52             : 
      53             :   public:
      54           4 :     explicit S104RasterBand(std::unique_ptr<GDALDataset> &&poDSIn)
      55           8 :         : m_poDS(std::move(poDSIn)),
      56           4 :           m_poUnderlyingBand(m_poDS->GetRasterBand(1))
      57             :     {
      58           4 :         eDataType = m_poUnderlyingBand->GetRasterDataType();
      59           4 :         m_poUnderlyingBand->GetBlockSize(&nBlockXSize, &nBlockYSize);
      60           4 :     }
      61             : 
      62             :     GDALRasterBand *
      63           8 :     RefUnderlyingRasterBand(bool /*bForceOpen*/ = true) const override
      64             :     {
      65           8 :         return m_poUnderlyingBand;
      66             :     }
      67             : 
      68           2 :     const char *GetUnitType() override
      69             :     {
      70           2 :         return m_osUnitType.c_str();
      71             :     }
      72             : 
      73           1 :     GDALRasterAttributeTable *GetDefaultRAT() override
      74             :     {
      75           1 :         return m_poRAT.get();
      76             :     }
      77             : };
      78             : 
      79             : /************************************************************************/
      80             : /*                                Open()                                */
      81             : /************************************************************************/
      82             : 
      83           5 : GDALDataset *S104Dataset::Open(GDALOpenInfo *poOpenInfo)
      84             : 
      85             : {
      86             :     // Confirm that this appears to be a S104 file.
      87           5 :     if (!S104DatasetIdentify(poOpenInfo))
      88           0 :         return nullptr;
      89             : 
      90             :     HDF5_GLOBAL_LOCK();
      91             : 
      92           5 :     if (poOpenInfo->nOpenFlags & GDAL_OF_MULTIDIM_RASTER)
      93             :     {
      94           1 :         return HDF5Dataset::OpenMultiDim(poOpenInfo);
      95             :     }
      96             : 
      97             :     // Confirm the requested access is supported.
      98           4 :     if (poOpenInfo->eAccess == GA_Update)
      99             :     {
     100           0 :         CPLError(CE_Failure, CPLE_NotSupported,
     101             :                  "The S104 driver does not support update access.");
     102           0 :         return nullptr;
     103             :     }
     104             : 
     105           8 :     std::string osFilename(poOpenInfo->pszFilename);
     106           8 :     std::string osGroup;
     107           4 :     if (STARTS_WITH(poOpenInfo->pszFilename, "S104:"))
     108             :     {
     109             :         const CPLStringList aosTokens(
     110           3 :             CSLTokenizeString2(poOpenInfo->pszFilename, ":",
     111           3 :                                CSLT_HONOURSTRINGS | CSLT_PRESERVEESCAPES));
     112             : 
     113           3 :         if (aosTokens.size() == 2)
     114             :         {
     115           0 :             osFilename = aosTokens[1];
     116             :         }
     117           3 :         else if (aosTokens.size() == 3)
     118             :         {
     119           3 :             osFilename = aosTokens[1];
     120           3 :             osGroup = aosTokens[2];
     121             :         }
     122             :         else
     123             :         {
     124           0 :             return nullptr;
     125             :         }
     126             :     }
     127             : 
     128           8 :     auto poDS = std::make_unique<S104Dataset>(osFilename);
     129           4 :     if (!poDS->Init())
     130           0 :         return nullptr;
     131             : 
     132           4 :     const auto &poRootGroup = poDS->m_poRootGroup;
     133             : 
     134          12 :     auto poWaterLevel = poRootGroup->OpenGroup("WaterLevel");
     135           4 :     if (!poWaterLevel)
     136             :     {
     137           0 :         CPLError(CE_Failure, CPLE_AppDefined, "Cannot find /WaterLevel group");
     138           0 :         return nullptr;
     139             :     }
     140             : 
     141          12 :     auto poDataCodingFormat = poWaterLevel->GetAttribute("dataCodingFormat");
     142           8 :     if (!poDataCodingFormat ||
     143           4 :         poDataCodingFormat->GetDataType().GetClass() != GEDTC_NUMERIC)
     144             :     {
     145           0 :         CPLError(CE_Failure, CPLE_AppDefined,
     146             :                  "Cannot find /WaterLevel/dataCodingFormat attribute");
     147           0 :         return nullptr;
     148             :     }
     149           4 :     const int nDataCodingFormat = poDataCodingFormat->ReadAsInt();
     150           4 :     if (nDataCodingFormat != 2)
     151             :     {
     152           0 :         CPLError(CE_Failure, CPLE_NotSupported,
     153             :                  "dataCodingFormat=%d is not supported by the S104 driver",
     154             :                  nDataCodingFormat);
     155           0 :         return nullptr;
     156             :     }
     157             : 
     158             :     // Read additional metadata
     159          12 :     for (const char *pszAttrName :
     160          16 :          {"methodWaterLevelProduct", "minDatasetHeight", "maxDatasetHeight"})
     161             :     {
     162          36 :         auto poAttr = poWaterLevel->GetAttribute(pszAttrName);
     163          12 :         if (poAttr)
     164             :         {
     165           8 :             const char *pszVal = poAttr->ReadAsString();
     166           8 :             if (pszVal)
     167             :             {
     168           8 :                 poDS->GDALDataset::SetMetadataItem(pszAttrName, pszVal);
     169             :             }
     170             :         }
     171             :     }
     172             : 
     173          12 :     auto poWaterLevel01 = poWaterLevel->OpenGroup("WaterLevel.01");
     174           4 :     if (!poWaterLevel01)
     175             :     {
     176           0 :         CPLError(CE_Failure, CPLE_AppDefined,
     177             :                  "Cannot find /WaterLevel/WaterLevel.01 group");
     178           0 :         return nullptr;
     179             :     }
     180             : 
     181             :     // Read additional metadata
     182          16 :     for (const char *pszAttrName :
     183             :          {"timeRecordInterval", "dateTimeOfFirstRecord", "dateTimeOfLastRecord",
     184          20 :           "numberOfTimes"})
     185             :     {
     186          48 :         auto poAttr = poWaterLevel01->GetAttribute(pszAttrName);
     187          16 :         if (poAttr)
     188             :         {
     189          16 :             const char *pszVal = poAttr->ReadAsString();
     190          16 :             if (pszVal)
     191             :             {
     192          16 :                 poDS->GDALDataset::SetMetadataItem(pszAttrName, pszVal);
     193             :             }
     194             :         }
     195             :     }
     196             : 
     197           8 :     if (auto poStartSequence = poWaterLevel01->GetAttribute("startSequence"))
     198             :     {
     199           4 :         const char *pszStartSequence = poStartSequence->ReadAsString();
     200           4 :         if (pszStartSequence && !EQUAL(pszStartSequence, "0,0"))
     201             :         {
     202           0 :             CPLError(CE_Failure, CPLE_AppDefined,
     203             :                      "startSequence (=%s) != 0,0 is not supported",
     204             :                      pszStartSequence);
     205           0 :             return nullptr;
     206             :         }
     207             :     }
     208             : 
     209           4 :     if (!S100GetNumPointsLongitudinalLatitudinal(
     210           4 :             poWaterLevel01.get(), poDS->nRasterXSize, poDS->nRasterYSize))
     211             :     {
     212           0 :         return nullptr;
     213             :     }
     214             : 
     215           4 :     const bool bNorthUp = CPLTestBool(
     216           4 :         CSLFetchNameValueDef(poOpenInfo->papszOpenOptions, "NORTH_UP", "YES"));
     217             : 
     218             :     // Compute geotransform
     219           4 :     poDS->m_bHasGT = S100GetGeoTransform(poWaterLevel01.get(),
     220           4 :                                          poDS->m_adfGeoTransform, bNorthUp);
     221             : 
     222           4 :     if (osGroup.empty())
     223             :     {
     224           2 :         const auto aosGroupNames = poWaterLevel01->GetGroupNames();
     225           1 :         int iSubDS = 1;
     226           2 :         for (const auto &osSubGroup : aosGroupNames)
     227             :         {
     228           2 :             if (auto poSubGroup = poWaterLevel01->OpenGroup(osSubGroup))
     229             :             {
     230           1 :                 poDS->GDALDataset::SetMetadataItem(
     231             :                     CPLSPrintf("SUBDATASET_%d_NAME", iSubDS),
     232             :                     CPLSPrintf("S104:\"%s\":%s", osFilename.c_str(),
     233             :                                osSubGroup.c_str()),
     234             :                     "SUBDATASETS");
     235           2 :                 std::string osSubDSDesc = "Values for group ";
     236           1 :                 osSubDSDesc += osSubGroup;
     237           2 :                 const auto poTimePoint = poSubGroup->GetAttribute("timePoint");
     238           1 :                 if (poTimePoint)
     239             :                 {
     240           1 :                     const char *pszVal = poTimePoint->ReadAsString();
     241           1 :                     if (pszVal)
     242             :                     {
     243           1 :                         osSubDSDesc = "Values at timestamp ";
     244           1 :                         osSubDSDesc += pszVal;
     245             :                     }
     246             :                 }
     247           1 :                 poDS->GDALDataset::SetMetadataItem(
     248             :                     CPLSPrintf("SUBDATASET_%d_DESC", iSubDS),
     249             :                     osSubDSDesc.c_str(), "SUBDATASETS");
     250           1 :                 ++iSubDS;
     251             :             }
     252             :         }
     253             :     }
     254             :     else
     255             :     {
     256           3 :         auto poGroup = poWaterLevel01->OpenGroup(osGroup);
     257           3 :         if (!poGroup)
     258             :         {
     259           1 :             CPLError(CE_Failure, CPLE_AppDefined,
     260             :                      "Cannot find /WaterLevel/WaterLevel.01/%s group",
     261             :                      osGroup.c_str());
     262           1 :             return nullptr;
     263             :         }
     264             : 
     265           4 :         auto poValuesArray = poGroup->OpenMDArray("values");
     266           2 :         if (!poValuesArray)
     267             :         {
     268           0 :             CPLError(CE_Failure, CPLE_AppDefined,
     269             :                      "Cannot find /WaterLevel/WaterLevel.01/%s/values array",
     270             :                      osGroup.c_str());
     271           0 :             return nullptr;
     272             :         }
     273             : 
     274           2 :         if (poValuesArray->GetDimensionCount() != 2)
     275             :         {
     276           0 :             CPLError(CE_Failure, CPLE_AppDefined,
     277             :                      "Wrong dimension count for %s",
     278           0 :                      poValuesArray->GetFullName().c_str());
     279           0 :             return nullptr;
     280             :         }
     281             : 
     282           2 :         const auto &oType = poValuesArray->GetDataType();
     283           2 :         if (oType.GetClass() != GEDTC_COMPOUND)
     284             :         {
     285           0 :             CPLError(CE_Failure, CPLE_AppDefined, "Wrong data type for %s",
     286           0 :                      poValuesArray->GetFullName().c_str());
     287           0 :             return nullptr;
     288             :         }
     289             : 
     290           2 :         const auto &oComponents = oType.GetComponents();
     291           2 :         if (oComponents.size() != 2 ||
     292           4 :             oComponents[0]->GetName() != "waterLevelHeight" ||
     293           2 :             oComponents[0]->GetType().GetNumericDataType() != GDT_Float32 ||
     294           6 :             oComponents[1]->GetName() != "waterLevelTrend" ||
     295           2 :             (oComponents[1]->GetType().GetNumericDataType() != GDT_Byte &&
     296             :              // In theory should be Byte, but 104US00_ches_dcf2_20190606T12Z.h5 uses Int32
     297           0 :              oComponents[1]->GetType().GetNumericDataType() != GDT_Int32))
     298             :         {
     299           0 :             CPLError(CE_Failure, CPLE_AppDefined, "Wrong data type for %s",
     300           0 :                      poValuesArray->GetFullName().c_str());
     301           0 :             return nullptr;
     302             :         }
     303             : 
     304           2 :         const auto &apoDims = poValuesArray->GetDimensions();
     305           2 :         if (apoDims[0]->GetSize() != static_cast<unsigned>(poDS->nRasterYSize))
     306             :         {
     307           0 :             CPLError(CE_Failure, CPLE_AppDefined,
     308             :                      "numPointsLatitudinal(=%d) doesn't match first dimension "
     309             :                      "size of %s (=%d)",
     310           0 :                      poDS->nRasterYSize, poValuesArray->GetFullName().c_str(),
     311           0 :                      static_cast<int>(apoDims[0]->GetSize()));
     312           0 :             return nullptr;
     313             :         }
     314           2 :         if (apoDims[1]->GetSize() != static_cast<unsigned>(poDS->nRasterXSize))
     315             :         {
     316           0 :             CPLError(CE_Failure, CPLE_AppDefined,
     317             :                      "numPointsLongitudinal(=%d) doesn't match second "
     318             :                      "dimension size of %s (=%d)",
     319           0 :                      poDS->nRasterXSize, poValuesArray->GetFullName().c_str(),
     320           0 :                      static_cast<int>(apoDims[1]->GetSize()));
     321           0 :             return nullptr;
     322             :         }
     323             : 
     324           2 :         if (bNorthUp)
     325           1 :             poValuesArray = poValuesArray->GetView("[::-1,...]");
     326             : 
     327             :         // Create waterLevelHeight band
     328             :         auto poWaterLevelHeight =
     329           6 :             poValuesArray->GetView("[\"waterLevelHeight\"]");
     330             :         auto poWaterLevelHeightDS = std::unique_ptr<GDALDataset>(
     331           4 :             poWaterLevelHeight->AsClassicDataset(1, 0));
     332             :         auto poWaterLevelHeightBand =
     333           4 :             std::make_unique<S104RasterBand>(std::move(poWaterLevelHeightDS));
     334           2 :         poWaterLevelHeightBand->SetDescription("waterLevelHeight");
     335           2 :         poWaterLevelHeightBand->m_osUnitType = "metre";
     336           2 :         poDS->SetBand(1, poWaterLevelHeightBand.release());
     337             : 
     338             :         // Create waterLevelTrend band
     339             :         auto poWaterLevelTrend =
     340           6 :             poValuesArray->GetView("[\"waterLevelTrend\"]");
     341             :         auto poWaterLevelTrendDS = std::unique_ptr<GDALDataset>(
     342           4 :             poWaterLevelTrend->AsClassicDataset(1, 0));
     343             :         auto poWaterLevelTrendBand =
     344           4 :             std::make_unique<S104RasterBand>(std::move(poWaterLevelTrendDS));
     345           2 :         poWaterLevelTrendBand->SetDescription("waterLevelTrend");
     346             : 
     347             :         // From D-5.3 Water Level Trend of S-101 v1.1 spec
     348           4 :         auto poRAT = std::make_unique<GDALDefaultRasterAttributeTable>();
     349           2 :         poRAT->CreateColumn("code", GFT_Integer, GFU_MinMax);
     350           2 :         poRAT->CreateColumn("label", GFT_String, GFU_Generic);
     351           2 :         poRAT->CreateColumn("definition", GFT_String, GFU_Generic);
     352             : 
     353             :         const struct
     354             :         {
     355             :             int nCode;
     356             :             const char *pszLabel;
     357             :             const char *pszDefinition;
     358           2 :         } aoRatValues[] = {
     359             :             {0, "Nodata", "No data"},
     360             :             {1, "Decreasing", "Becoming smaller in magnitude"},
     361             :             {2, "Increasing", "Becoming larger in magnitude"},
     362             :             {3, "Steady", "Constant"},
     363             :         };
     364             : 
     365           2 :         int iRow = 0;
     366          10 :         for (const auto &oRecord : aoRatValues)
     367             :         {
     368           8 :             int iCol = 0;
     369           8 :             poRAT->SetValue(iRow, iCol++, oRecord.nCode);
     370           8 :             poRAT->SetValue(iRow, iCol++, oRecord.pszLabel);
     371           8 :             poRAT->SetValue(iRow, iCol++, oRecord.pszDefinition);
     372           8 :             ++iRow;
     373             :         }
     374             : 
     375           2 :         poWaterLevelTrendBand->m_poRAT = std::move(poRAT);
     376             : 
     377           2 :         poDS->SetBand(2, poWaterLevelTrendBand.release());
     378             :     }
     379             : 
     380           3 :     poDS->GDALDataset::SetMetadataItem(GDALMD_AREA_OR_POINT, GDALMD_AOP_POINT);
     381             : 
     382             :     // Setup/check for pam .aux.xml.
     383           3 :     poDS->SetDescription(osFilename.c_str());
     384           3 :     poDS->TryLoadXML();
     385             : 
     386             :     // Setup overviews.
     387           3 :     poDS->oOvManager.Initialize(poDS.get(), osFilename.c_str());
     388             : 
     389           3 :     return poDS.release();
     390             : }
     391             : 
     392             : /************************************************************************/
     393             : /*                      S104DatasetDriverUnload()                       */
     394             : /************************************************************************/
     395             : 
     396           6 : static void S104DatasetDriverUnload(GDALDriver *)
     397             : {
     398           6 :     HDF5UnloadFileDriver();
     399           6 : }
     400             : 
     401             : /************************************************************************/
     402             : /*                         GDALRegister_S104()                          */
     403             : /************************************************************************/
     404          10 : void GDALRegister_S104()
     405             : 
     406             : {
     407          10 :     if (!GDAL_CHECK_VERSION("S104"))
     408           0 :         return;
     409             : 
     410          10 :     if (GDALGetDriverByName(S104_DRIVER_NAME) != nullptr)
     411           0 :         return;
     412             : 
     413          10 :     GDALDriver *poDriver = new GDALDriver();
     414             : 
     415          10 :     S104DriverSetCommonMetadata(poDriver);
     416          10 :     poDriver->pfnOpen = S104Dataset::Open;
     417          10 :     poDriver->pfnUnloadDriver = S104DatasetDriverUnload;
     418             : 
     419          10 :     GetGDALDriverManager()->RegisterDriver(poDriver);
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